História školy sa začína písať prvým augustom 1985, keď odbor školstva v Humennom zrušil činnosť materskej školy a Zriaďovacou listinou zo dňa 20.08.1985 zriadil Osobitnú školu  na Sninskej ulici v Humennom.

V školskom roku 1985/86 mala škola štyri triedy, ktoré  doposiaľ  patrili pod  Osobitnú školu internátnu v Medzilaborciach. Z dôvodu rekonštrukcie budovy  školy, bolo potrebné umiestniť triedy do iných objektov - jednu  na ZŠ Pugačevova  v Humennom,  druhú na ZŠ Duchnovičova v Humennom a dve triedy  boli elokované  na ZŠ v Snine. V tomto  roku mala škola 57 žiakov.

Rekonštrukcia školy bola  síce ukončená k 01.09.1986, no neustále narastajúci počet tried, a v dôsledku toho nepostačujúce  priestory, si aj v nasledujúcich rokoch vyžadovalo, aby aj naďalej niektoré z nich  boli vysunuté na základné školy v Humennom alebo do Sniny.   

Školský rok 1993/1994 bol prelomovým. Z predchádzajúcich provizórnych priestorov sa škola presťahovala na Třebíčsku 16,  Humenné, do priestorov bývalej materskej školy, kde sídli dodnes.

Prvý január 1997 znamenal  v jej histórii významný medzník. Krajský školský úrad v Prešove Zriaďovacou listinou zo dňa 20.12.1996 zriadil Osobitnú školu,  Třebíčska 16,  Humenné  ako samostatnú rozpočtovú organizáciu s právnou subjektivitou.

Zriaďovacou listinou zo dňa 29.09.2000 mení Krajský školský úrad v Prešove od 1.09.2000 názov školy z pôvodného Osobitná škola  na Špeciálna základná škola. 

Škola sa nachádza v  prostredí mestskej obytnej zóny. Z východnej  strany susedí s hrádzou rieky Laborec. Zastavanú časť objektu  školy  tvorí päť  samostatných pavilónov. Tieto, spolu  s rozsiahlym  školským pozemkom s prevažne ihličnatým porastom, vytvárajú zázemie, umožňujúce vykonávať plnohodnotný výchovno-vzdelávací proces pre žiakov s mentálnym postihnutím  a  pre žiakov zo znevýhodneného  sociálneho  prostredia.